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Methodenkurs Molekulardynamik

Datum: 22.09.2020 (09:00 h) - 02.10.2020 (17:00 h)
Ort: Uni Regensburg, ZOOM

 
Zweitägiger Methodenkurs zur Molekulardynamik.
 
Zeitraum: 22.09.2020 - 02.10.2020
 
Die exakten Termine werden mit den jeweiligen Interessenten abgesprochen. 
Hierfür bitte eine Mail an philipp.dullinger@uni-r.de.
 
Tag 1:
 
+ Überblick über Molekulardynamik
+ Größen, die als Ensambleaverage beschrieben werden können (Druck, Temperatur, Dichte, ...)
+ Autocorrelationsfunktionen und Größen, die über diese beschrieben werden können (Diffusionskoeffizient, Viskosität, ...)
+ "Tricks" zur Erhöhung der Schrittgröße
 
Tag 2:
 
+ Methoden zur Berechnung von Differenzen der Freien Energie
+ Größen, die mit der Kirkwood-Buff Theorie beschrieben werden
 
Beide Tage werden jeweils in einen Kurs mit Hintergrundinformationen und einen Übungsteil unterteilt.
Für letzteren benötigen alle Teilnehmer einen PC/Laptop, da wir coronabedingt noch keine ZIP-Pools reservieren dürfen.
 
Für den Kurs wird Gromacs, ORCA, Python und acpype benötigt.
(Unixartige Systeme sind daher von Vorteil.
Für Windows-Nutzer wird empfohlen das Linux-Subsystem zu verwenden.)
Die Installation der Programmpakete wird zu Beginn des Kurses durchgeführt.
 

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